11岁时，艾伦（格兰特·古斯汀GrantGustin饰）的母亲离奇死亡，而他的父亲则被当成了凶bbb。之后，警探乔（杰西·马丁JesseL.Martin饰）收留了孤苦伶仃的艾伦，在乔的耳濡目染之下，成年后的艾伦成为了一名CSI鉴证分析员，在此过程中，他一直没有放弃过对于母亲真正死因的调查。　　艾伦十分迷恋科学家哈里森（汤姆·加瓦那TomCavanagh饰）所研究的粒子加速器，然而，一场意外让加速器发生了爆炸，艾伦被击中陷入了昏迷。九个月后，终于苏醒的艾伦惊讶的发现自己体内产生了神奇的变化，因此而获得了特殊能力。随着时间的推移，艾伦开始明白，这个世界上，还有很多和自己一样拥有超能力的人存在，而保护市民的安全成为了他新的责任和任务。

X档案关闭后，穆德（DavidDuchovny大卫•杜楚尼饰）和斯科莉（GillianAnderson吉莲•安德森饰）被分ddd。穆德受命执行监听工作，斯科莉则回到学院读书。　　某日国会议员麦特森（RaymondJ.Barry饰）向穆德透露一条消息，称在波多黎各接收到外星人的电讯。为了在特种部队之前找到外星人的证据，穆德只身前往。得知消息的斯科莉赶到穆德住处，从电脑中的旅客名单中找到线索，尾随来到波多黎各。　　在波多黎各阿雷希伯，穆德偶遇一个当地人，并从他手里得到一幅外星人的画。但不久后此人便离奇死去。穆德最终能否找到外星人来访的证据？